从2001年起，经相关中学申请，学院从办学理念、教学课程设置、师资水平和学生质量等方面进行了实地考察，先后与全国二十二所中学签署了“清华大学美术学院生源基地实验学校”协议，并对上述学校实行三年一期的考核挂牌制，对协议期满考核结果不合格的生源基地校将不再续签协议，截止到2013年12月共有生源基地学校16所，名单如下：
生源基地学校名称 | 备注 | |
河北省石家庄市第二中学 | 2009年12月续签协议 | |
湖北省武汉市汉口铁路高级中学 | 2009年12月续签协议 | |
新疆乌鲁木齐市第一中学 | 2009年12月续签协议 | |
山东省烟台市牟平育英艺术中学 | 2010年12月续签协议 | |
黑龙江省实验中学 | 2011年9月续签协议 | |
江苏省南京市宁海中学 | 2011年9月续签协议 | |
吉林省吉林毓文中学 | 2011年9月续签协议 | |
辽宁省大连市第十五中学 | 2011年9月续签协议 | |
北京中央工艺美术学院附属中学 | 2011年9月续签协议 | |
清华大学附属中学 | 2011年9月续签协议 | |
河南省郑州市第101中学 | 2011年9月续签协议 | |
深圳清华实验学校 | 2011年9月续签协议 | |
保定市美术中学 | 2009年12月签署协议 | |
广东省惠州市博罗县华侨中学 | 2009年12月签署协议 | |
天津美术学院附属高中 | 2009年12月签署协议 | |
河南省郑州市第106中学 | 2011年9月签署协议 |
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