农学与园艺技术学院：园艺技术、中草药栽培技术、作物生产技术、园林技术、烟草栽培与加工、林业技术休闲农业畜牧兽医学院：畜牧兽医、宠物养护与驯导、动物医学、宠物临床诊疗技术、水产养殖技术食品药品与大健康学院：药品生产技术、食品检测技术、农产品加工与质量检测、食品质量与安全、药品经营与管理、食品药品监督管理、药品质量与安全、中药学、烹调工艺与营养工程学院：工程造价、水利工程、工程测量技术、汽车检测与维修技术、建设项目信息化管理、园林工程技术互联网技术学院：计算机网络技术、计算机应用技术、软件技术、云计算技术与应用、大数据技术与应用、电子商务经济管理学院：财务管理、行政管理、农业经济管理、会计信息管理、市场营销
2、云南农业职业技术学院比较好的专业名单省级重点建设专业：畜牧兽医
省级特色专业：园艺技术、园林技术专业、作物生产技术《高等职业教育创新发展行动计划（2015—2018 年）》项目认定骨干专业：园艺技术、畜牧兽医、工程造价
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