首先，这一点希望大家清楚，教育部门并没有划分新疆第二医学院是一本还是二本，毕业证上只有本科和专科之分，是几本只是民间的说法。（某大学在某省是第一批次招生的话，通常认为该大学是一本大学，在第二批次招生的话，通常认为该大学是二本大学）
根据公开信息可知：新疆第二医学院在新疆和全国基本是本科二批招生，所以我们通常认为新疆第二医学院是二本大学。（注：自2017年开始，新疆高考本科二批、三批合并为本科二批招生）
根据全国985和211大学名单可知，新疆第二医学院不是211大学也不是985大学。新疆没有985大学，以下是新疆所有211大学名单：
新疆211大学名单
新疆医科大学厚博学院于2003年5月6日在乌鲁木齐获准成立，2004年2月5日由国家教育部教发函〔2004〕13号文件确认，是由新疆医科大学举办的、充分依托大学优质教育资源和办学优势建设发展的独立学院。2012年12月6日，克拉玛依市委市政府与新疆医科大学共同签订了合作建设新疆医科大学厚博学院协议书。2015年9月新校区落成，学院正式搬迁至克拉玛依市。
2017年5月，克拉玛依市委市政府与新疆医科大学就双方进一步合作办好厚博学院进行了协商，之后克拉玛依市委市政府与新疆医科大学签订了《新疆医科大学与克拉玛依市人民政府共建厚博学院备忘录》，根据备忘录精神，新疆医科大学厚博学院拟更名为“新疆医科大学克拉玛依学院”，定位为医学类院校。
经教育部党组会议研究决定，同意新疆医科大学厚博学院转设为新疆第二医学院，学校标识码为4165013560；同时撤销新疆医科大学厚博学院的建制。
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