根据全国985和211大学名单可知：福建医科大学不是985大学，也不是211大学。
全国共有115所211大学，39所985大学，其中福建有2所211大学，1所985大学，目前教育部门不再接受211和985大学申报，已经统筹为双一流大学建设。
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和排名情况| 序号 | 学校名称 |
| 1 | 厦门大学 |
211工程，即在21世纪重点建设100所左右的高等学校和一批重点学科的建设工程，是新中国成立以来由国家立项在高等教育领域进行的规模最大、层次最高的重点建设工作，是中国政府实施“科教兴国”战略的重大举措。
985工程，1998年5月4日，在庆祝北京大学建校100周年大会上提出“为了实现现代化，我国要有若干所具有世界先进水平的一流大学”，985工程一期建设率先在北京大学和清华大学开始实施。
福建医科大学是福建省重点建设高校之一，其前身是创办于1937年的福建省立医学专科学校。1939年改名为福建省立医学院。1949年改称福建医学院。1969年，与福建中医学院、华侨大学医疗系合并，成立福建医科大学。1982年更名为福建医学院。1996年4月更名为福建医科大学，教育部"卓越医生教育培养计划"试点高校。
学校已形成学士-硕士-博士人才培养体系，成为一所集教学、科研、医疗、预防和社会服务为一体的省属医科大学。2003年，被福建省人民政府确定为重点建设高校。同年以良好的成绩通过了教育部本科教学工作水平评估。
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