北京神外所江涛教授团队《Genomics Proteomics Bioinformatics》发表中国脑胶质瘤基因组图谱数据库

2021年3月，北京市神经外科研究所江涛教授团队在生物信息学领域权威杂志《Genomics, Proteomics & Bioinformatics (GPB)》在线发表题为“Chinese Glioma Genome Atlas (CGGA): A Comprehensive Resource with Functional Genomic Data from Chinese Gliomas”的论文，介绍了中国第一个完备的脑胶质瘤基因图谱计划(CGGA)数据库的数据内容及使用方法。北京市神经外科研究所赵征助理研究员、张克难和王强威博士研究生为共同第一作者，北京市神经外科研究所江涛教授和附属北京天坛医院神经外科保肇实副主任医师为共同通讯作者。

脑胶质瘤是成人最常见的颅内恶性肿瘤，年发病率约5-8/10万人。患者预后不良，常于手术后复发，对患者家庭及社会产生了巨大的经济和心理负担。近年来，随着脑胶质瘤分子生物学研究不断深入，越来越多的生物学标记物被发现并指导临床诊治。脑胶质瘤功能基因组学数据的全面收集和共享有助于加速科学研究和临床转化，对临床治疗对策和国家肿瘤防控政策的制定具有重要指导意义。

为了推动中国脑胶质瘤基础与临床医学研究，2004年，江涛教授团队开始着手构建中国人群脑胶质瘤生物样本库并持续追踪患者随访。2012年，依托于北京市神经外科研究所、首都医科大学附属北京天坛医院，江涛教授团队发起了“中国脑胶质瘤基因组图谱计划”，致力于中国脑胶质瘤患者功能基因组学信息的整合与共享，为脑胶质瘤基础研究与临床转化研究提供服务和支撑。2019年，历经十五年的样本与信息收集以及功能组学数据测定，江涛教授团队构建了国内首个脑胶质瘤功能基因组学数据库——CGGA数据库。

CGGA数据库的主要内容

CGGA数据库是第一个完备的中国脑胶质瘤患者队列的功能基因组学信息库。该信息库的建设包括标准样本采集、测序、分析流程、数据存储与共享等。CGGA数据库坚持长期随访，最大随访时间逾15年。自上线以来，CGGA不断更新完善，丰富数据内容、更新随访信息、提升可视化效果。CGGA数据库能够在线可视化分析全外显子组、转录组学及小RNA、DNA甲基化芯片平台等数据资源，极大方便了用户对胶质瘤基因组学的分析研究，推动了我国胶质瘤基础及临床研究进展。当前CGGA的部分原始测序数据储存于中科院国家生物信息学中心的组学原始数据归档库。CGGA数据库中所有功能组学数据和临床资料供全世界研究者开放使用。

该研究得到国家“十一五”科技支撑计划（2007BAI05B08）、863计划课题（2012AA02A508）、国家重点研发计划（2016YFC0902500）、北京市科技计划（Z131****06113018）、国际合作专项项目（2012DFA30470）等项目支持。

江涛，主任医师，教授，博士生导师。现任北京市神经外科研究所副所长，首都医科大学附属北京天坛医院神经外科中心副主任。主要从事脑胶质瘤诊治及研究工作。先后当选中国医师协会和中国抗癌协会脑胶质瘤专业委员会首任主委、中国神经科学学会神经肿瘤分会主委、亚洲脑胶质瘤基因组图谱计划主席等。主持参与“863”国家高技术研究与发展项目、“973”国家基础研究项目、“十一五”国家科技支撑计划项目、国家重点研发计划项目、国家自然科学基金等课题，在Cell、Annals of Oncology、Nature Communications、PNAS等杂志发表论文300余篇，主持制订国家卫健委《脑胶质瘤诊疗规范》，主持编写5部指南（含国际指南1部），主编专著9部。以第一完成人获国家科技进步二等奖1项、省部级一等奖2项，成果入选2018年度“中国生命科学十大进展”。

保肇实，首都医科大学附属北京天坛医院副主任医师。主要从事脑胶质瘤疾病的手术治疗及发病机制研究。主持国家自然科学基金、北京市“杰出青年”科学基金等多项课题。以第一或通讯作者在Cell、Genome Research、Neuro-Oncology等杂志发表论文17篇。

作者：北京市神经外科研究所、科技处

图文编辑：党委宣传部

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